По сообщениям "Коммерсант" причиной аварии могло стать попадание "Фобос-Грунта" в зону работы американского радара. По данным "Коммерсанта", причинами аварии так же могли стать короткое замыкание на аппарате и вариант физического сбоя. Комиссия по расследованию инцидента завершит работу 20 января 2012 года. После чего доклад будет передан главе Роскосмоса и затем обнародован.