Сотрудники Radical Entertainment сообщили некоторую информацию о совершенствовании главного героя Prototype 2 Джеймса Хеллера. Как говорят разработчики, игрок будет со временем вносить в себя способности Хеллера. Создатели обещали не повторять ошибок в принятии решении, как с Prototype. Дизайнер Мэтт Армстронг открыл весь функционал после убийства первого босса. Все преимущества Алекса Мерсера понадобилось подвергнуть долгим тестам для оптимальных требований. Для развития способностей игроку необходимо будет исследовать пещеры под Нью-Йорком со страшными монстрами.